 |  |
КОНФОРМАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ ЦИСТЕИНСОДЕРЖАЩИХ ПЕПТИДОВ И ОЦЕНКА ПЕРСПЕКТИВНОСТИ ИХ ИСПОЛЬЗОВАНИЯ КАК ХЕЛАТОРОВ 213 Bi В ПРЕПАРАТАХ ДЛЯ ТЕРАПИИ РАКОВЫХ ОПУХОЛЕЙ
© 2006 г . Т. В. Гогитидзе*, В. П. Демушкин* , Е. В. Жаворонкова*, В. В. Копытов*, Н. С. Марченков**
*Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, 117997 ГСП, Москва, В-437, ул. Миклухо-Маклая, 16/10;
**Российский научный центр “Курчатовский институт”, Москва
Поступила в редакцию 08.09.2005 г. Принята к печати 29.12.2005 г.
На основе метода конформационного анализа проведен анализ пространственной структуры пептидов – (Cys-Gly)3, (Cys-Gly)3-Asp, (Cys-Gly)3-Glu, (Cys-Ala)3, (Cys-Glu)3 и (Cys-Gly-Gly)3, аналогов фитохелатинов и ряда фрагментов металлотионеинов. Изучены все возможные низкоэнергетические конформации исследуемых молекул, выявлена роль внутри- и межостаточных взаимодействий в формировании пространственных структур. Показана различная степень предрасположенности рассмотренных молекул к принятию конформаций, благоприятствующих связыванию ионов висмута. Низкоэнергетические структуры, обеспечивающие оптимальное связывание атомов висмута, наиболее часто встречаются для (Cys-Ala)3. Среди аналогов пептидных фрагментов металлотионеинов, не встречающихся в природных пептидах, выявлены низкоэнергетические пентапептидные фрагменты ССXXС (X = Gln, Asn, Phe, Tyr и Gly), имеющие в конформации альфа-спирали расстояния между атомами серы, соответствующие расстояниям в Bi2S3.
Ключевые слова: пептиды, конформационный анализ, фитохелатины, металлотионеины, хелаторы, радионуклиды.
Биоорг. химия 2006, 32 (3):268-275