БЕЛОК S3 В 80S РИБОСОМЕ ЧЕЛОВЕКА СОСЕДСТВУЕТ С мРНК С 3’-СТОРОНЫ ОТ КОДОНА В А-УЧАСТКЕ

© 2007 г. М. В. Молотков, Д. М. Грайфер, Е. А. Попугаева, К. Н. Булыгин, М. И. Мещанинова, А. Г. Веньяминова, Г. Г. Карпова^#

^#Тел.: (383) 335-62-29; e-mail: karpova@niboch.nsc.ru

Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, 630090, Новосибирск, просп. Лаврентьева, 8

Поступила в редакцию 05.06.2006 г. Принята к печати 15.06.2006 г.

С помощью набора производных олигорибонуклеотидов, несущих триплет UUU на 5’-конце и перфторарилазидогруппу на одном из нуклеотидных остатков с 3’-стороны от этого триплета, изучено белковое окружение мРНК в 80S рибосоме с 3’-стороны от кодона в А-участке (декодирующем центре). Аналоги мРНК фазировали на рибосоме с помощью связывания в Р-участке тРНК^Phe, узнающей кодон UUU. Облучение комплексов рибосом с тРНК^Phe и аналогами мРНК мягким УФ-светом приводило к сшивке последних преимущественно с компонентами 40S субчастицы, причем главным образом с белками и, в меньшей степени, с рРНК. Среди рибосомных белков 40S субчастицы основной мишенью модификации во всех случаях является белок S3. Кроме того, наблюдали слабую сшивку с белком S2. Cшивка с белками S3 и S2 происходила как в тройных комплексах, так и в отсутствие тРНК. В составе тройных комплексов наблюдали также сшивку с белком S15, эффективность которой резко падала при перемещении модифицированного нуклеотида из положения +5 в положение +12 относительно первого нуклеотида кодона в Р-участке. В некоторых случаях в составе тройных комплексов наблюдали сшивку с белком S30, которая была наиболее сильной в случае производного с фотоактивируемой группой на остатке аденозина в положении +7. Полученные результаты указывают на то, что в рибосоме человека белок S3 играет ключевую роль в организации участка связывания мРНК с 3’-стороны от кодона в декодирующем центре.

Ключевые слова: 80S рибосома; мРНК-связывающий центр; аналог мРНК; фотоаффинное сшивание; рибосомные белки.

Биоорг. химия 2007, 33(4): 431-441