ДИАГНОСТИКА ФИТОПАТОГЕННЫХ ГРИБОВ SEPTORIA TRITICI И STAGONOSPORA NODORUM МЕТОДОМ FLASH-ПЦР
© 2008 г. С. Л. Абрамова*, Д. Ю. Рязанцев**, Т. М. Войнова*, С. К. Завриев*,**#
#Тел.: (495) 335-15-11; e-mail: szavriev@ibch.ru
*Всероссийский научно-исследовательский институт фитопатологии РАСХН, 143050, Московская обл., пос. Большие Вяземы; **Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинников, РАН, 117977, Москва, ул. Миклухо-Маклая, 16/10
Поступила в редакцию 12.03.2007 г. Принята к печати 26.04.2007 г.
На основе полимеразной цепной реакции в формате FLASH (Fluorescent Amplification-based Specific Hybridization) разработана система, позволяющая диагностировать и идентифицировать два важных грибных патогена пшеницы Septoria tritici (телеоморфа Mycosphaerella graminicola) и Stagonospora nodorum (телеоморфа Phaeosphaeria nodorum), вызывающих пятнистость листьев и колосковых чешуек соответственно. Определение наличия патогена основано на амплификации фрагмента ДНК внутреннего транскрибируемого спейсера 1 (ВТС1) и участка, кодирующего 5.8S рибосомальную РНК, в область последней подобраны универсальный праймер и зонд типа «бикон», обеспечивающий детекцию получаемых продуктов в формате FLASH. Разработанная система проверена на различных изолятах патогенов, образцах инфицированных листьев и семян пшеницы, а также почвы.
Ключевые слова: ПЦР, пшеница, септориоз, диагностика; Septoria tritici, Stagonospora nodorum, фитопатоген.
Биоорг. химия 2008, 34(1): 107-113