АНАЛОГИ ОЛИГОНУКЛЕОТИДОВ, СОДЕРЖАЩИЕ АЦИКЛОНУКЛЕОЗИД С АМИДНОЙ МЕЖНУКЛЕОТИДНОЙ СВЯЗЬЮ

© 2008 г. С. В. Кочеткова, Е. А. Филлипова, Н. А. Колганова, Э. Н. Тимофеев, В. Л. Флорентьев^#

^#Тел.: (495) 135-21-82; факс: (495) 135-14-05; e-mail: flor@imb.ac.ru

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН, 119991, Москва, ул. Вавилова, 32

Поступила в редакцию 19.03.2007 г. Принята к печати 09.04.2007 г.

Синтезированы аналоги олигонуклеотидов, содержащие ациклоцитидин, связанный с тимидином амидной (3'-O-CH₂-CO-N-5') связью. Измерены кривые плавления дуплексов, образованных модифицированными олигонуклеотидами с комплементарными природными, и рассчитаны термодинамические параметры их образования. Замена в олигонуклеотиде одного динуклеотида dCpT на модифицированный лишь умеренно снижает температуру плавления дуплексов, образованных таким олигонуклеотидом с комплементарным природным, в сравнении с немодифицированными дуплексами. Изучены КД-спектры модифицированных дуплексов, обсуждается их пространственное строение.

Ключевые слова: аналоги олигонуклеотидов; гибридизация; ациклонуклеозид; амидная межнуклеотидная связь; термическая стабильность.

Биоорг.химия 2008, 34(2): 227-235