ЛИМИТИРУЮЩАЯ СТАДИЯ ЭНТЕРОПЕПТИДАЗНОГО ГИДРОЛИЗА

© 2008 г. А. Г. Михайлова^#, В. В. Лихарева, Л. Д. Румш

^#Тел.: (495) 335-42-22; факс: (495) 335-71-03; e-mail: anna@enzyme.siobc.ras.ru

Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, 117997 ГСП, Москва, В-437, ул. Миклухо-Маклая, 16/10

Поступила в редакцию 07.05.2007 г. Принята к печати 06.07.2007 г.

Впервые продемонстрирован лимитирующий характер стадии деацилирования при энтеропептидазном гидролизе высокоэффективных олигопептидных субстратов, содержащих четыре остатка Asp в Р2–Р5-положениях. Напротив, гидролиз низкоэффективных пептидных субстратов, содержащих менее четырех остатков Asp или Glu в Р2–Р5-положениях, происходит с лимитирующей стадией ацилирования, как это ранее предполагалось для всех амидных и пептидных субстратов сериновых протеиназ на основании классических работ Бендера и соавт. Для определения лимитирующей стадии при энтеропептидазном гидролизе тиобензилового эфира N^α-бензилоксикарбонил-L-лизина, высокоэффективного амидного субстрата β-нафтиламида GlyAsp₄-Lys, а также низкоэффективного пептидного субстрата VLSAADK-GNVKAAWG (дефис – место гидролиза) был применен метод введения дополнительного нуклеофила или другого эффектора, селективно влияющего на стадию деацилирования.

Ключевые слова: энтеропептидаза, пептидные субстраты, лимитирующая стадия гидролиза, метод дополнительного нуклеофила.

Биоорг.химия 2008, 34(2): 204-209