АНТИГЕННЫЕ ПОЛИСАХАРИДЫ БАКТЕРИЙ. 41. УТОЧНЕННЫЕ СТРУКТУРЫ О-СПЕЦИФИЧЕСКИХ ПОЛИСАХАРИДОВ Shigella dysenteriae ТИПОВ 4 И 5 ПО ДАННЫМ СПЕКТРОСКОПИИ ЯМР
© 2008 г. А. В. Перепелов* #, С. Н. Сенченкова*, А. С. Шашков*, Ю. А. Книрель*, Б. Лю**, ***, Л. Фенг**, ***, Л. Ванг**, ***
#Тел./факс: (495) 137-61-48; e-mail: perepel@ioc.ac.ru
*Институт органической химии им. Н.Д. Зелинского РАН, 119991, Москва, Ленинский просп., 47, Российская Федерация; **Школа биологических наук и биотехнологии Нанкайского университета, Тянь-дзинь, ТЕДА, КНР; ***Лаборатория функциональной геномики микробов колледжа ТЕДА Нанкайского университета, Тянь-дзинь, ТЕДА, КНР
Поступила в редакцию 02.08.2007 г. Принята к печати 22.08.2007 г.
Строение изученных ранее кислых О-специфических полисахаридов двух типовых штаммов бактерий Shigella dysenteriae уточнено с использованием современных методов спектроскопии ЯМР. Исправления коснулись конфигурации гликозидной связи остатков GlcNAc (S. dysenteriae типа 4) и маннозы (S. dysenteriae типа 5). Кроме того, у бактерии S. dysenteriae типа 4 локализованы сайты нестехиометрического О-ацетилирования, причем О-ацетилирование бокового остатка фукозы носит случайный характер, а у бактерии S. dysenteriae типа 5 уточнено положение О-ацетильной группы, присутствующей в стехиометрическом количестве. Исправленные структуры полисахаридов приведены ниже. Обнаруженная ранее идентичность структур О-специфических полисахаридов S. dysenteriae типа 5 и Escherichia coli O58 подтверждена с помощью 13C-ЯМР-спектроскопии, и, следовательно, структура полисахарида E. coli O58 должна быть пересмотрена таким же образом.
где L-Rhap3Rlac2Ac – 2-O-ацетил-3-O-[(R)-1-карбоксиэтил]-L-рамноза.
Ключевые слова: Shigella dysenteriae, О-антиген; О-специфический полисахарид, структура, спектроскопия ЯМР.