ОЛИГО(2'-О-МЕТИЛРИБОНУКЛЕОТИДЫ) И ИХ ПРОИЗВОДНЫЕ. III*. 5'-МОНО- И 5'-БИСПИРЕНИЛЬНЫЕ ПРОИЗВОДНЫЕ ОЛИГО(2'-О-МЕТИЛРИБОНУКЛЕОТИДОВ) И ИХ 3'-МОДИФИЦИРОВАННЫХ АНАЛОГОВ. СИНТЕЗ И СВОЙСТВА

© 2008 г. Д. С. Новопашина, О. С. Тоцкая, С. А. Холодарь, М. И. Мещанинова, А. Г. Веньяминова^#

^#Тел.: (383) 335-62-75; факс: (383) 333-36-77; e-mail: ven@niboch.nsc.ru

Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, 630090, Новосибирск, просп. Лаврентьева, 8

Поступила в редакцию 11.07.2007 г. Принята к печати 15.10.2007 г.

Синтезированы 5'-пиренилметилфосфамидные и 5'-биспиренилметилфосфодиамидные производные олиго(2'-О-метилрибонуклеотидов) и их аналогов, содержащих на 3'-конце тимидин, присоединенный 3'–3'-фосфодиэфирной межнуклеотидной связью ("инвертированный" тимидин). Изучено влияние остатка(ов) пирена на термическую стабильность дуплексов модифицированных олигонуклеотидов с РНК и ДНК. Продемонстрирована возможность детекции гибридизации 5'-моно- и 5'-биспиренильных производных с РНК- и ДНК-мишенями в растворе по изменению флуоресценции. Методом термической денатурации образующихся дуплексов, регистрируемой по изменению флуоресценции, показано, что 5'-пиренилметилфосфамидные производные олиго(2'-О-метилрибонуклеотидов) и их 3'-"инвертированных" аналогов являются чувствительными зондами для детекции однонуклеотидных замен в РНК и ДНК.

Ключевые слова: олиго(2'-О-метилрибонуклеотиды) с терминальной 3'–3'-межнуклеотидной связью; 1-пиренилметиламин; флуоресценция; детекция нуклеиновых кислот, мисматчи; термическая денатурация дуплексов.

* Сообщение II см.: Sergeeva Z.A., Lokhov S.G., Ven’yaminova A.G. // Russ. J. of Bioorganic Chemistry. 1996. V. 22. P. 800–806 (Сергеева З.А., Лохов С.Г., Веньяминова А.Г. // Биоорган. химия. 1996. Т. 22. С. 916–922).

Биоорг.химия 2008, 34 (5): 671-682