КОНФОРМАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ ЦИКЛИЧЕСКИХ ДИПЕПТИДОВ. I.

© 2008 г. С. Ф. Архипова, И. В. Артемьев, Е. А. Горячева, В. З. Плетнев#

#Тел.: (495) 330-75-10; e-mail: goryacheva@ibch.ru

Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, 117997, ГСП, Москва, В-437, ул. Миклухо-Маклая, 16/10

Поступила в редакцию 16.08.2007 г. Принята к печати 12.12.2007 г.

Методом молекулярной механики выполнен теоретический конформационный анализ двух пар синтетических циклодипептидов, образованных путем взаимодействия функциональных групп как боковых цепей – так и боковой и основной цепей – . Установлены энергетически предпочтительные конформационные состояния исследуемых молекул. Показано, что конформационная подвижность циклической системы исследуемых соединений зависит от взаимного расположения амидных групп и числа атомов в цикле.

Ключевые слова: циклический дипептид, пептидомиметик, молекулярная механика, конформация.

Биоорг.химия 2008, 34 (5): 610-616