МОЛЕКУЛЯРНЫЕ ДЕСКРИПТОРЫ АМИНОКИСЛОТ ДЛЯ ОЦЕНКИ ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКИХ ПАРАМЕТРОВ И БИОЛОГИЧЕСКОЙ АКТИВНОСТИ ПЕПТИДОВ
© 2009 г. Е. Ю. Тюнина#, В. Г. Баделин
#Тел.: (4932) 33-65-62; e-mail: tey@isc-ras.ru
Институт химии растворов РАН, 153045, Иваново, ул. Академическая, 1
Поступила в редакцию 14.10.2008 г. Принята к печати 05.12.2008 г.
С использованием методов регрессионного анализа получены статистически значимые корреляционные соотношения структура–активность для двух групп олигопептидов (48 дипептидов, входящих в структуру аналогов ингибиторов ангиотензинпревращающего фермента, и 21 пентапептида, структурных аналогов брадикининов). Для характеристики молекулярной структуры пептидов использованы геометрические, гидрофобные и электронные дескрипторы исходных аминокислот. Показано, что наибольшее влияние на биоактивность исследуемых соединений оказывают электронные свойства (электроотрицательность, полярность молекул и способность к образованию водородных связей). Удовлетворительное согласие между вычисленными и экспериментально определенными значениями биоактивности (lgA) пептидов свидетельствует о пригодности четырехпараметрового уравнения для оценки неизвестных значений lgA олигопептидов, исходя из физико-химических параметров составляющих их аминокислот.
Ключевые слова: пептиды, аналоги ингибиторов ангиотензинпревращающего фермента, брадикинины, корреляционные соотношения структура–активность, структурные дескрипторы.
Биоорг.химия 2009, 35 (4): 501-509