НОВЫЕ СПОСОБЫ ГЕНЕРАЦИИ СИГНАЛА ФЛУОРЕСЦЕНЦИИ ПРИ АНАЛИЗЕ ОДНОНУКЛЕОТИДНЫХ ЗАМЕН С ПОМОЩЬЮ ХИМЕРНЫХ ГИБРИДИЗАЦИОННЫХ ЗОНДОВ В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ
© 2009 г. Р. Р. Гарафутдинов*#, Ю. М. Никоноров*, Д. А. Чемерис*, Б. Н. Постригань*, О. В. Чубукова*, Р. Ф. Талипов**, В. А. Вахитов*, А. В. Чемерис*
#Тел./факс: (347) 235-60-88; e-mail: garafutdinovr@mail.ru
*Институт биохимии и генетики Уфимского научного центра РАН, 450054, Уфа, просп. Октября, 71; **Башкирский государственный университет, Уфа
Поступила в редакцию 16.12.2008 г. Принята к печати 25.03.2009 г.
Предложены новые варианты генерации и усиления сигнала флуоресценции при анализе однонуклеотидных замен в режиме реального времени. Для генерации флуоресценции использованы меченые ДНК-РНК-ДНК-химерные олигонуклеотидные зонды, которые отжигаются на ДНК-мишени, образующейся в ходе аллель-специфического лигирования «С-зонда» и последующей изотермической амплификации по методу «катящегося кольца», и разрушаются в ходе реакций ферментативного и дезоксирибозимного расщепления.
Ключевые слова: однонуклеотидный полиморфизм; химерные гибридизационные зонды, дезоксирибозимы; технология циклического зонда; амплификация по методу «катящегося кольца».