2’-АЛЬДЕГИДНЫЕ ОЛИГОНУКЛЕОТИДЫ. СИНТЕЗ И ПРИМЕНЕНИЕ ДЛЯ АФФИННОЙ МОДИФИКАЦИИ ДНК-УЗНАЮЩИХ БЕЛКОВ

© 2010 г. Е. А. Хомякова*, Е. В. Казанова*^#, Е. М. Зубин*, Е. А. Кубарева**, Н. В.  Молочков***, Е. М.  Рязанова****, Т. С. Орецкая*

^#Тел.: (495) 939-31-48; факс: (495) 939-31-81; e-mail: evkazanova@mail.ru

*Химический факультет МГУ им. М.В. Ломоносова, 119991, Москва, Воробьевы горы, 1;
**НИИ физико-химической биологии им. А.Н. Белозерского МГУ им. М.В. Ломоносова, Москва;
***Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАН, Московская обл., Пущино;
****Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной биотехнологии РАСХН, Москва

Поступила в редакцию 27.10.2009 г. Принята к печати 03.11.2009 г.

Олигонуклеотиды, содержащие в своем составе 1,2-диольную группу, синтезированы с использованием 3’-амидофосфита 2’-O-[2-(2,3-дигидроксипропил)амино-2-оксоэтил]уридина. Изучена термическая стабильность модифицированных ДНК-дуплексов. Исследован характер их комплексообразования с субъединицей р50 фактора транскрипции NF-κB и С5-цитозиновой ДНК-метилтрансферазой M.SsoII. Окисление 1,2-диольной группы олигонуклеотидов периодатом натрия позволяет получать реакционноспособные 2’-альдегидные производные. Изучена возможность их использования для аффинной модификации ДНК-узнающих белков.

Ключевые слова: модифицированные олигонуклеотиды; ДНК-белковые взаимодействия, аффинная модификация.