РАЙОН 1112–1123 ЦЕНТРАЛЬНОГО ДОМЕНА 18S рРНК В 40S СУБЧАСТИЦАХ РИБОСОМ РАСТЕНИЙ: ДОСТУПНОСТЬ ДЛЯ КОМПЛЕМЕНТАРНЫХ ВЗАИМОДЕЙСТВИЙ И ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ РОЛЬ

^#Карпова Г.Г. (тел.: (383) 335-62-29, e-mail: karpova@niboch.nsc.ru); Искаков Б.К. (тел.: +7(727) 292-0329, e-mail: bulat.iskakov@mail.ru)

*Институт молекулярной биологии и биохимии им. М.А. Айтхожина Республиканского государственного предприятия «Центр биологических исследований» Комитета науки Министерства образования и науки Республики Казахстан, 050012, Алматы, ул. Досмухамедова, 86, Республика Казахстан;
**Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, 630090, Новосибирск, просп. акад. Лаврентьева, 8, Россия

Поступила в редакцию 04.07.2009 г. Принята к печати 01.09.2009 г.

Изучено связывание 18S рРНК в составе 40S субчастиц рибосом зародышей пшеницы с олигодезоксирибонуклеотидом, комплементарным участку 1112–1123 в центральном домене этой рРНК. Показано, что этот олигомер способен селективно связываться с комплементарным участком рРНК и ингибировать трансляцию некэпированных химерных мРНК, содержащих энхансерные последовательности в 5’-нетранслируемой области перед репортерной последовательностью, кодирующей β-глюкуронидазу, в бесклеточной белоксинтезирующей системе. С использованием производного данного олигомера, несущего алкилирующую группу на 5’-конце, показано, что район 1112–1123 18S рРНК может участвовать в образовании гетеродуплекса с комплементарной последовательностью олигомера. Полученные данные свидетельствуют о том, что участок 1112–1123 в шпильке 27 центрального домена 18S рРНК в составе 40S субчастиц рибосом растений экспонирован на поверхности и, возможно, участвует в кэп-независимом связывании субчастиц с мРНК за счет комплементарных взаимодействий с энхансерными последовательностями.

Ключевые слова: рибосомы растений; трансляция; мРНК, энхансерные последовательности; 18S рибосомная РНК; олигонуклеотиды и их реакционноспособные производные, комплементарно-адресованная модификация.