ОЛИГОНУКЛЕОТИДНЫЙ МИКРОЧИП ДЛЯ ТИПИРОВАНИЯ НЕЙРАМИНИДАЗЫ ВИРУСА ГРИППА А

© 2010 г. В. А. Рябинин*^#, Е. В. Костина*, А. А. Неверов**, Г. А. Максакова*, А. Н. Синяков*

^#Тел.: (3832) 330-46-53, факс: (3832) 333-36-77; e-mail: ryabinin@niboch.nsc.ru

*Новосибирский институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, 630090, Новосибирск, просп. Акад. Лаврентьева, 8;
**Лаборатория разработки методов Центра оценки и исследований биопрепаратов, Управление по контролю за пищевыми продуктами и лекарственными препаратами, США

Поступила в редакцию 19.08.2009 г. Принята к печати 16.12.2009 г.

Разработан олигонуклеотидный микрочип для типирования нейраминидазы вируса гриппа А. Отбор зондов микрочипа включал в себя нахождение аминокислотных последовательностей, специфичных для определяемого подтипа нейраминидазы, исходя из которых проводился расчет олигонуклеотидных зондов с последующей дополнительной селекцией наиболее специфичных и представительных зондов. Для определения каждого подтипа нейраминидазы использовалось от 19 до 24 олигонуклеотидных зондов. При тестировании микрочипа на 19 образцах вируса гриппа А с наиболее распространенными подтипами нейраминидазы (N1 и N2) наблюдалось однозначное типирование 18 из них и лишь один изолят не был идентифицирован.

Ключевые слова: вирус гриппа А; нейраминидаза; микрочипы; типирование; диагностика.