ОПЫТ ИЗУЧЕНИЯ МЕТОДАМИ СИСТЕМНОЙ БИОЛОГИИ ФУНКЦИОНАЛЬНОЙ РОЛИ ФЕРМЕНТАТИВНОЙ МОДИФИКАЦИИ БАКТЕРИАЛЬНОЙ РИБОСОМЫ

© 2011 г. П. В. Сергиев*^#, И. А. Остерман*, И. В. Прохорова*, М. В. Нестерчук^*, О. В. Сергеева*, А. Я. Головина*, И. А. Дёмина**, М. А. Галямина**, М. В. Серебрякова**, О. А. Донцова*

^#Тел.: (495) 939-54-18; факс: (495) 939-31-81; e-mail: petya@genebee.msu.su

*Научно-исследовательский институт физико-химической биологии им. А.Н. Белозерского и химический факультет Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова, 119992, Москва, Воробьевы горы, 1;
**Научно-исследовательский институт физико-химической медицины Росздрава, Москва

Поступила в редакцию 06.07.2010 г. Принята к печати 16.08.2010 г.

В работе предложена разработанная нами методология изучения роли модификации бактериальной рибосомы в регуляции экспрессии генов. Модификация отдельных компонентов бактериальной рибосомы влияет на эффективность трансляции некоторых мРНК. Изменение белкового состава клетки, вызванное делецией генов, отвечающих за модификацию рибосомы, детектируется с помощью протеомного анализа. С помощью репортерных конструкций определяется стадия экспрессии генов, отвечающая за изменение количества того или иного белка. После определения тех мРНК, которые транслируются с разной эффективностью, в штамме, имеющем только немодифицированные рибосомы, и в штамме дикого типа мы определяем участок мРНК, отвечающий за наблюдаемые изменения. Предложенная методология также может быть использована для изучения других механизмов регуляции трансляции.

Ключевые слова: протеомика, трансляция, регуляция, экспрессия генов, Escherichia coli.