ПОИСК И ИДЕНТИФИКАЦИЯ ПЕПТИДОВ МХА Physcomitrella patens
© 2011 г. А. Ю. Скрипников*,**#, Н. А. Аниканов*,**, В. С. Казаков*, С. В. Долгов***, Р. Х. Зиганшин*, В. М. Говорун*,****, В. Т. Иванов*,**
#Тел.: 495-939-1268; e-mail: a.skripnikov@gmail.com
*Учреждение РАН Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, 117997 ГСП, Москва, В-437, ул. Миклухо-Маклая, 16/10; **Биологический факультет МГУ им. М.В. Ломоносова, Москва; ***Филиал Института биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, Пущино; ****Научно-исследовательский институт физико-химической медицины Росздрава, Москва
Поступила в редакцию 08.06.2010 г. Принята к печати 17.08.2010 г.
Описаны выделение и идентификация пептидов мха Physcomitrella patens (Hedw.) B.S.G., активно используемого в последние годы в качестве модельного организма для изучения биологии растений. Впервые показано, что протопласты, протонема и гаметофоры Ph. patens содержат разнообразные пептиды. Из гаметофоров было выделено и идентифицировано 58 пептидов, являющихся фрагментами 14 белков, а из протонемы – 49 пептидов, фрагментов 15 белков. При этом было установлено, что протонема и гаметофоры Ph. patens, являющиеся последовательными стадиями развития этого растения, значительно отличаются друг от друга как пептидным составом, так и спектром белков-предшественников идентифицированных пептидов. Выделение протопластов при ферментативном разрушении клеточной стенки протонемы сопровождается массовой деградацией внутриклеточных белков, значительную долю которых составляют белки системы фотосинтеза, что является характерной реакцией высших растений на стрессовые воздействия факторов среды. Всего из протопластов мха было выделено и идентифицировано 323 пептида, являющихся фрагментами 79 белков.
Ключевые слова: пептидомика; растительные пептиды; Physcomitrella patens; протопласты; Q-TOF.