АНАЛИЗ ЭНХАНСЕРНОЙ АКТИВНОСТИ ФРАГМЕНТОВ ДНК ИЗ ОБЛАСТИ FXYD5-COX7A ХРОМОСОМЫ 19 ЧЕЛОВЕКА
© 2011 г. А. Н. Соротокина#, И. П. Чернов, Е. А. Стукачева, Л. Г. Николаев, Е. Д. Свердлов
#Тел.: (495) 330-70-29; факс: (495) 330-65-38; e-mail: ansorotokina@gmail.com
Учреждение РАН Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук, 117997 ГСП, Москва, В-437, ул. Миклухо-Маклая, 16/10
Поступила в редакцию 18.05.2010 г. Принята к печати 07.07.2010 г.
Исследована энхансерная активность четырех идентифицированных ранее фрагментов ДНК из участка хромосомы 19 человека длиной 1 млн п.о. Все четыре фрагмента обладают сходной тканеспецифичностью – максимальная энхансерная активность наблюдается в клетках HEK293, а минимальная – в клетках HeLa. Полученные фрагменты также обладают выраженной специфичностью энхансерной активности по отношению к промотору цитомегаловируса по сравнению с промотором SV40. Делеционный анализ одного из фрагментов выявил, что энхансерной активностью обладает только его центральная часть длиной 127 п.о. Во фланкирующих областях располагаются, по-видимому, либо негативные регуляторные элементы (сайленсеры), либо инсуляторные элементы, ограничивающие действие энхансера на промотор. Энхансерная активность центральной части исследованного фрагмента обладает ярко выраженной зависимостью от ее ориентации относительно промотора, что не характерно для большинства таких элементов. Фрагмент длиной 127 п.о. содержит 11 участков связывания известных факторов транскрипции, причем 8 из них относятся к факторам, участвующим в регуляции активности генов иммунной системы. Исследованный фрагмент находится в 500 п.о. от точки начала транскрипции гена TYROBP (DAP12), кодирующего адапторный белок активации киллерных Т-клеток, и, возможно, играет роль тканеспецифичного энхансера для этого гена.
Ключевые слова: энхансер; промотор; тканеспецифичность; делеционный анализ.