НОВЫЙ КОНФОРМАЦИОННЫЙ ПЕПТИДНЫЙ АНТИГЕН, МОДЕЛИРУЮЩИЙ ИММУНОДОМИНАНТНЫЙ ЭПИТОП 2-Й ВНЕКЛЕТОЧНОЙ ПЕТЛИ β₁-АДРЕНОРЕЦЕПТОРА. КОМПЬЮТЕРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ, СИНТЕЗ, ИЗУЧЕНИЕ ПРОСТРАНСТВЕННОЙ СТРУКТУРЫ

©2013 г. Р. Ш. Бибилашвили, М. В. Сидорова^#, А. С. Молокоедов, Ж. Д. Беспалова, Э. В. Бочаров*, Е. Е. Ефремов, Т. В. Шарф, М. М. Рогова, Н. А. Миронова, К. А. Зыков, С. П. Голицын

^#Тел.: + 7 (495) 414-67-16, факс: +7 (495) 414-67-86, e-mail: peptide1@cardio.ru

ФГБУ «Российский кардиологический научно-производственный комплекс» Минздрава РФ, 121552, Москва, 3-я Черепковская ул., 15а;
*ФГБУН Институт биоорганической химии имени академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, 117997, Россия, Москва, ул. Миклухо-Маклая, 16/10;
НБИКC-Центр НИЦ «Курчатовский институт», 123182, Россия, Москва, пл. Академика Курчатова, 1

Поступила в редакцию 18.04.2013 г. Принята к печати 16.06.2013 г.

С помощью методов компьютерного моделирования построена полипептидная структура конформационного антигена, имитирующего иммунодоминантный эпитоп 2-й внеклеточной петли β₁-адренорецептора. Твердофазным методом с использованием Fmoc-технологии проведен химический синтез линейного 25-членного предшественника, соответствующего рассчитанной аминокислотной последовательности, затем путем направленного замыкания дисульфидных мостиков получен оригинальный бициклический полипептид, соответствующий предложенной структуре конформационного антигена. С помощью спектроскопии ЯМР высокого разрешения изучена пространственная структура синтетического конформационного антигена. При этом показано, что структура бициклического полипептида близка к структуре построенной компьютерной модели. Бициклический конформационный антиген оказался пригодным для выявления аутоантител в сывортках крови больных с нарушениями ритма и проводимости без признаков органического заболевания сердечно-сосудистой системы.

Ключевые слова: β₁-адренорецептор, конформационный пептидный антиген, компьютерное моделирование, пептиды, синтез, пространственная структура, спектроскопия ЯМР, идиопатическая аритмия.

Биоорг. химия 2013, 39 (6): 658-670