СИНТЕЗ TaqMan-ЗОНДОВ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ БИСФОСФОРАМИДИТА ЦИАНИНОВОГО КРАСИТЕЛЯ Cy3

© 2016 г. В. А. Рябинин^#, Е. В. Костина, Г. А. Максакова, А. Н. Синяков

^#Тел.: +7 (3832) 363-51-73, e-mail: ryabinin@niboch.nsc.ru

Новосибирский институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, 630090, Новосибирск, пр. Акад. Лаврентьева, 8

Поступила в редакцию 23.12.2014 г. Принята к печати 24.04.2015 г.

Предложен метод синтеза TaqMan-зондов с использованием бисфосфорамидита цианинового красителя Cy3. При проведении синтеза происходит образование двух вариантов производных, в которых к красителю присоединены один или два олигонуклеотида, несущих на 3'-конце тушитель флуоресценции, с преимущественным образованием первого варианта. Показано, что при проведении ПЦР в реальном времени более эффективен зонд классической структуры, несущий один олигонуклеотид.

Ключевые слова: цианиновые красители, бисфосфорамидиты, ПЦР, зонды TaqMan.

Биоорг. химия 2016, 42 (1): 122-126