ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ДЕЙТЕРО/ВОДОРОДНОГО ОБМЕНА ДЛЯ ИССЛЕДОВАНИЯ ВТОРИЧНОЙ СТРУКТУРЫ СУПЕРМЕТАЛЛИЗИРОВАННЫХ КОМПЛЕКСОВ УБИКВИТИНА С ЦЕРИЕМ (III)

© 2016 г. Ю. И. Костюкевич*^, **^, ***, П. В. Яковлев****, А. С. Кононихин**^, ****^, *****, И. А. Попов***^, ****, А. Е. Бугрова***^, *****, Н. Л. Стародубцева****^, *****, Е. Н. Николаев^1, *^, **_, ****

^#Тел.: +7 (916) 549-10-47; эл. почта: ennikolaev@rambler.ru

*АНОО ВПО “Сколковский институт науки и технологий”, Россия, Московская обл, Одинцовский р-н, дер. Сколково, ул. Новая, 100;
**ФГБУН Институт энергетических проблем химической физики им. В.Л. Тальрозе РАН;
***ФГБУН Институт биохимической физики им. Н.М. Эмануэля РАН;
****ФГАОУ ВПО “Московский физико-технический институт (государственный университет)”, Россия, Московская обл., г. Долгопрудный;
*****ФГБУ Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика В.И. Кулакова Министерства здравоохранения РФ

Поступила в редакцию 07.12.2015 г. Принята к печати 03.03.2016 г.

DOI: 10.7868/S0132342316040114

Для исследования конформационных изменений суперметаллизированных ионов убиквитина атомами церия(III) применен метод дейтеро/водородного обмена в сочетании с масс-спектрометрией сверхвысокого разрешения. Получены зависимости эффективности дейтеро/водородного обмена от зарядового состояния иона убиквитина, количества присоединенных к нему атомов церия, а также от температуры. Для проведения дейтеро/водородного обмена использовался ранее описанный метод проведения реакции дейтеро/водородного обмена напрямую в источнике ионизации. Обнаружено, что количество обменов практически не меняется при добавлении атомов церия. Данный результат косвенно свидетельствует о том, что конформация суперметаллизированых ионов малых белков существенно не изменяется во время ионизации электроспреем.

Ключевые слова: белки, вторичная структура, убиквитин, дейтеро/водородный обмен, масс-спектрометрия, электроспрей

Биоорг. химия 2016, 42 (5): 539-545