МАСС-СПЕКТРОМЕТРИЧЕСКОЕ ОПРЕДЕЛЕНИЕ АМИНОКИСЛОТНОЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ КОРОТКИХ И СРЕДНИХ ПЕПТИДОВ В СИСТЕМЕ ESI-O-TOF ВМЕСТО МС/МС. I. ИЗБИРАТЕЛЬНАЯ ФРАГМЕНТАЦИЯ ПЕПТИДОВ С ПРЕИМУЩЕСТВЕННЫМ ОБРАЗОВАНИЕМ У-ИОНОВ

^#Тел.: +7 (495) 330-75-92, эл. почта: nazimov@ibch.ru

*ФГБУН Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, 117997, ГСП-7, Москва, В-437, ул. Миклухо-Маклая, 16/10;
**ФГБУН Институт аналитического приборостроения РАН, Санкт-Петербург

Поступила в редакцию 20.11.2017 г. Принята к печати 07.03.2018 г.

DOI: 10.1134/S0132342318050135

Экспериментально показана принципиальная возможность масс-спектрометрического секвенирования пептидов без использования общепринятого МС/МС-анализа. Пептидный гидролизат разделен на микроколонке методом обращенно-фазовой хроматографии. Фракцию элюата подавали в узел ввода образца масс-спектрометра методом электрораспыления в режиме прямой стыковки жидкостного хроматографа с времяпролетным масс-спектрометром (ВЭЖХ-МС). Фрагментацию пептидов хроматографического элюата проводили в узле ввода элюата в масс-спектрометр путем изменения разности потенциалов между соплом и скиммером масс-спектрометра. Получен ограниченный набор интенсивных пиков y-ионов, соответствующих последовательному отщеплению всех аминокислот пептида. Отношение интенсивности фрагментных y-ионов к фону составляло (5–100)/1. Наличие Lys и Arg в составе пептидов существенно повышает интенсивность информативных пиков масс-спектров. Масс-спектры коротких пептидов (содержащих до 10 а.о.) расшифровывали вручную, для обработки результатов фрагментации длинного N-концевого пептида α-цепи гемоглобина человека использовали программно-аппаратный комплекс “Proteos”.

Ключевые слова: масс-спектрометрия, электрораспыление, пептиды, фрагментация, y-ионы.

Биоорг. химия 2018, 44 (5): 481-491