ПРОСТРАНСТВЕННАЯ СТРУКТУРА РЕКОМБИНАНТНОЙ ТЕРМОФИЛЬНОЙ АДЕНИНФОСФОРИБОЗИЛТРАНСФЕРАЗЫ ИЗ ШТАММА БАКТЕРИЙ T. thermophilus НВ27
© 2018 г. Р. С. Есипов*, #, В. И. Тимофеев*, Е. В. Синицына*, Е. С. Тузова*, Л. В. Есипова*, М. А. Костромина*, И. П. Куранова*, А. И. Мирошников*
#Тел.: +7 (495) 336-68-33; +7 (499) 135-62-20; эл. почта: esipov@mx.ibch.ru; inna@ns.crys.ras.ru
*Институт биоорганической химии им. акад. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, 117997, Москва, ул. Миклухо-Маклая 16/10
Поступила в редакцию 23.01.2018 г. Принята к печати 20.02.2018 г.
DOI: 10.1134/S0132342318050044
Аденинфосфорибозилтрансфераза (APRT) из термофильного штамма бактерий Thermus thermophilus НВ27 (TthHB27APRT) принадлежит к семейству фосфорибозилтрансфераз (PRT) первого типа и катализирует магний-зависимый перенос 5'-фосфорибозильной группы 5'-фосфорибозилпирофосфата на N9-положение аденина с образованием аденозин-5'-монофосфата и пирофосфата. Кристаллы рекомбинантного фермента для рентгеноструктурного исследования выращены в капилляре методом встречной диффузии. Кристаллы, принадлежащие к пространственной группе Р21, имели следующие параметры элементарной ячейки: a = 69.860, b = 82.160, c = 91.390, α = 90.00, β = 102.58, γ = 90.00 и содержали шесть мономеров фермента в независимой части ячейки. По дифракционному набору, собранному от выращенных кристаллов на синхротроне Spring 8 (Япония), пространственная структура белка решена методом молекулярного замещения с использованием программы BALBES при разрешении 2.7 Å. Описан ход полипептидной цепи в субъединице фермента и строение биологически активного димера. На основании сравнения со структурами гомологичных белков (APRT термофильного штамма TthHB8 и APRT Homo sapiens) локализовано положение активного центра фермента и ряда функционально важных аминокислотных остатков.
Ключевые слова: аденинфосфорибозилтрансфераза, кристаллизация, пространственная структура.
Биоорг. химия 2018, 44 (5): 506-513