IDENTIFICATION AND CHARACTERISTICS OF CONSERVED microRNA IN TESTIS TISSUE FROM CHINESE GIANT SALAMANDER (Andrias davidianus) BY DEEP SEQUENCING ¹

^#E-mail: huangyong1979111@126.com

*College of Animal Science and Technology, Henan University of Science and Technology, Luoyang, 471023 China;
**Guangdong Province Key Laboratory of Fish Ecology and Environment, Guangzhou, 510300 China

Поступила в редакцию 25.05.2018 г. После доработки 20.09.2018 г. Принята к публикации 08.10.2018 г.

DOI: 10.1134/S0132342319020179

Идентификация и характеристика консервативных микроРНК в тканях семенников китайской исполинской саламандры (Andrias davidianus) с помощью глубокого секвенирования. МикроРНК представляют собой семейство некодирующих одноцепочечных последовательностей РНК длиной около 22 нуклеотидов, которые, будучи вовлеченными в регуляцию таких разных биологических процессов, как развитие гонад, дифференциация и диморфизм, считаются ключевыми регуляторами генной экспрессии. Несмотря на то, что большинство исследованных микроРНК были обнаружены в животных, сведения о микроРНК в амфибиях скудны. Идентификация полного репертуара микроРНК в семенниках китайской исполинской саламандры Andrias davidianus внесет значительный вклад в знания о физиологических функциях микроРНК в гонадах. В данном исследовании, небольшая библиотека РНК была получена из тканей семенников взрослой особи A. davidianus и секвенирована с помощью методов глубокого секвенирования. В результате получено 26401474 чистых прочтений и идентифицировано 1340 известных ранее консервативных микроРНК. Кроме того, экспрессия 12 случайно выбранных микроРНК из 5 разных образцов тканей A. davidianus была подтверждена методом количественной ПЦР в реальном времени. Среди них повышенная экспрессия в семенниках была характерна для aca-miR-99b-5p, xtr-miR-10c и cfa-miR-363. Хотя физиологическое значение этих микроРНК осталось невыясненным, их профили экспрессии указывают на то, что они вероятно играют важную роль в процессах роста и развития семенников A. davidianus, что требует дальнейшего исследования. Результаты работы способствуют лучшему пониманию роли микроРНК в регуляции репродуктивной системы A. davidianus.

Ключевые слова: Andrias davidianus, микроРНК, глубокое секвенирования, семенники, количественная ПЦР в реальном времени
______________________

¹ Полный текст статьи печатается в английской версии журнала

Биоорг. химия 2019, 45 (3): 302-302