СТРУКТУРА О-СПЕЦИФИЧЕСКОГО ПОЛИСАХАРИДА И ЛИПИДА А ТИПОВОГО ШТАММА БАКТЕРИЙ Azospirillum rugosum DSM-19657
© 2020 г. Е. Н. Сигида*, #, М. С. Кокоулин**, П. С. Дмитренок**, В. С. Гринёв*, ***, Ю. П. Федоненко*, ***, С. А. Коннова*, ***
#Тел.: +7 (8452) 97-04-44; факс: +7 (8452) 97-04-03; эл. почта: si_elena@mail.ru
*Институт биохимии и физиологии растений и микроорганизмов РАН, Россия, 410049, Саратов, просп. Энтузиастов, 13; **Тихоокеанский институт биоорганической химии имени Г.Б. Елякова ДВО РАН, Россия, 690022, Владивосток, Проспект 100 лет Владивостоку, 159; ***Саратовский национальный исследовательский государственный университет имени Н.Г. Чернышевского, Россия, 410012, Саратов, ул. Астраханская, 83
Поступила в редакцию 08.07.2019 г. После доработки 28.07.2019 г. Принята к публикации 16.08.2019 г.
DOI: 10.31857/S0132342320010133
Проведены структурные исследования липополисахарида типового штамма азотфиксирующих почвенных бактерий Azospirillum rugosum, выделенного из загрязненных нефтью почв. На основании данных химического анализа, 1D- и 2D- 1H- и 13С-ЯМР-спектроскопии установлено, что О-специфический полисахарид состоит из повторяющихся звеньев двух типов, идентичных обнаруженным ранее в О-пецифическом полисахариде штамма Azospirillum brasilense Jm125A2. Структурный анализ липида А c применением ГЖХ и МАЛДИ-масс-спектрометрии выявил смесь пента-, тетра- и триацильных типов молекул. Первичными жирными кислотами в липиде А являются N-связанная 16:0(3-OH)- и О-связанная 14:0(3-OH). Микрогетерогенность в пределах каждого типа обусловлена природой вторичных жирных кислот (16:0, 18:1 или 19:0), ацилирующих 16:0(3-OH)-кислоту дистального кольца GlcN.
Ключевые слова: Azospirillum rugosum, липополисахарид, О-специфический полисахарид, липид А, ЯМР-спектроскопия, МАЛДИ-масс-спектрометрия
Биоорг. химия 2020, 46 (1): 65-76